Využití metody Real Time-PCR v detekci genů pro dekarboxylační enzymy u vybraných bakterií

Abstract

Předkládaná diplomová práce se zabývá zavedením metody Real Time-PCR pro detekci speF genu, tedy genu kódujícího ornithindekaboxylasu. Tento enzym katalyzuje dekarboxylaci L-ornithinu na putrescin u Gram negativních bakterií. Putrescin je jedním z hlavních biogenních aminů, jehož výskyt je úzce spojován s mikrobiálním kažením potravin. V průběhu práce byla rovněž sledována exprese daného genu, metodou relativní kvantifikace, u Escherichia coli v závislosti na rozdílných kultivačních podmínkách. Získané výsledky dokumentují, že byla zavedena a optimalizována metoda Real Time-PCR pro detekci speF genu. Pomocí této metody je rovněž možné sledovat úroveň exprese daného genu v závislosti na různých podmínkách.