Syntéza rotaxanových struktur s vícevazebnými ligandy

DSpace Repository

Language: English čeština 

Syntéza rotaxanových struktur s vícevazebnými ligandy

Show simple item record

dc.contributor.advisor Vícha, Robert
dc.contributor.author Závodná, Aneta
dc.date.accessioned 2025-03-18T13:11:47Z
dc.date.available 2025-03-18T13:11:47Z
dc.date.issued 2019-09-01
dc.identifier Elektronický archiv Knihovny UTB
dc.identifier.isbn 978-80-7678-323-2 cs
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10563/56826
dc.description.abstract Molekulární přepínače či spínače jsou zajímavé především díky svým potenciálním aplikacím v široké škále oblastí, včetně elektroniky či medicíny. Rotaxany, tedy mechanicky uzamčené molekuly, sestávající z cyklické molekuly navlečené na druhou, lineární molekulu, představující osu systému, se v určitých případech mohou chovat jako molekulární spínače. Obě komponenty rotaxanu jsou vzájemně kineticky zachyceny, jelikož objemné skupiny nacházející se na obou koncích lineární komponenty jsou zpravidla větší než je vnitřní průměr kavity makrocyklu, a proto nemůže tento komplex disociovat. Rotaxany lze také považovat za jakési úložiště jejich cyklické složky, což rozšiřuje jejich potenciál jako doplněk k systémům, které si během funkce zachovávají své mechanické propojení. V naší práci jsme navrhli tři generace ligandů pro tvorbu rotaxanových systémů založených na cucurbit[6]urilu (CB6), jejichž osy jsou vybaveny dodatečným vysoce afinitním vazebným motivem pro další makrocykly, v podobě cucurbit[7]urilu (CB7) a b-cyklodextrinu (b-CD). Ligandy první generace se lišily délkou centrálního vazebného motivu, zatímco koncové motivy pro navléknutí CB6 (isobutyl, IB) a pro komplexaci s CB7 (1-adamantyl, Ad) zůstaly stejné. Příprava zamýšlených rotaxanů byla úspěšná pouze u ligandu s hexylový motivem, jelikož délky ostatních (4C, 8C, 10C) nebyly ideální pro zachycení CB6. Struktury představující ligandy druhé generace nesly objemnější neopentylový terminální motiv navržený pro navlékání CB6. Nicméně, ani příprava těchto rotaxanů nebyla úspěšná, jelikož neopentylový motiv je již příliš objemný a neumožnil navléknutí CB6 na osu za jakýchkoli námi použitých podmínek. A konečně, úspěšně připravené rotaxany třetí generace sestávaly z IB konce, hexan-1,6-diammoniového centrálního motivu a druhého konce odvozeného od adamantanu, kde rozdíl spočíval v délce spojky mezi adamantanovou klecí a kladně nabitým atomem dusíku (od methylu po fenylenmethyl). Tato práce pomocí nejkratšího rotaxanu (s methylenovou spojkou) demonstruje, že navázání CB7 na alosterické vazebné Ad místo významně zvyšuje vnitřní energii systému, která je dostatečná pro překonání mechanické bariéry. To znamená, že elektrostatická repulze mezi portály obou jednotek CBn je využita k rozložení rotaxanu na jeho samotnou cyklickou a lineární složku. Jak se ukázalo, tak kinetiku procesu vyvlékání lze ladit délkou alosterického vazebného místa, na které se váže CB7 (ethylenová, propylenová a propenylenová spojka). CB6 pak může být, po "osvobození" z rotaxanového systému, využit k tvorbě supramolekulárních komplexů s jinými hosty (například sperminem) přítomnými ve směsi.
dc.format 46 cs
dc.language.iso en
dc.publisher Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně
dc.rights Bez omezení
dc.subject rotaxan cs
dc.subject supramolekulární chemie cs
dc.subject molekulární přepínač cs
dc.subject molekulární signál cs
dc.subject alosterická aktivace cs
dc.subject multitopické ligandy cs
dc.subject rotaxane en
dc.subject supramolecular chemistry en
dc.subject molecular switch en
dc.subject molecular signal en
dc.subject allosteric activation en
dc.subject multitopic ligands en
dc.title Syntéza rotaxanových struktur s vícevazebnými ligandy
dc.title.alternative Synthesis of Rotaxane Structures with Multitopic Ligands
dc.type disertační práce cs
dc.contributor.referee Lhoták, Pavel
dc.contributor.referee Pischel, Uwe
dc.date.accepted 2025-02-07
dc.description.abstract-translated Molecular switches are of considerable interest due to their potential applications in a wide range of fields, including electronics, sensing or medicine. Rotaxanes, i.e., mechanically interlocked molecules, consisting of a ring-shaped molecule (macrocycle) threaded onto an axle-like molecule (thread), can act as molecular switches in certain cases. Both rotaxane components are kinetically trapped as the bulky groups at both ends of the thread are usually larger than the internal diameter of the macrocycle, and therefore this complex cannot undergo dissociation. Rotaxanes can be also considered as a storage of their ring component, which expands their application potential as a complement to the systems that retain the mechanically interlocked manner. In our work, we designed three generations of ligands for the formation of cucurbit[6]uril (CB6) based rotaxane systems, whose axes are equipped with an additional high-affinity binding motif for another macrocycles, cucurbit[7]uril (CB7) and b-cyclodextrin (b-CD). First-generation ligands differed in the length of their central binding motif, while terminal motifs for CB6 slippage (isobutyl, IB) and binding of CB7 (1-adamantylmethyl, Ad) remained invariant. The formation of intended rotaxanes was successful only with the ligand featuring a hexyl motif, as the lengths of the others were not ideal for capturing the CB6. Structures representing second-generation ligands carried bulkier neopentyl-derived terminal moiety for CB6 slipping-on. However, these rotaxanes were not prepared either, as the neopentyl motif is too bulky and does not allow the threading of CB6 under any conditions we used. Finally, successfully assembled rotaxanes of the third-generation consisted of an IB end, 1,6-hexanediammonium centre linker and variable Ad-derived terminal moieties. The difference lay in the length of the linker between the Ad cage and the positively charged nitrogen atom (from methylene to phenylenemethyl spacer). By the shortest rotaxane (with methylene linker), this thesis demonstrates that binding of CB7 to the allosteric Ad binding site, significantly increases the energy of the system which is sufficient for the mechanical barrier to be overcome. This means, that the electrostatic repulsion between the portals of the two CBn units can be employed to disassemble a rotaxane to its ring and axle components. Moreover, the kinetics of the slipping-off process can be tuned by the length of the allosteric binding site where the CB7 acts (ethylene, propylene, propenylene spacer). Finally, upon liberation from the rotaxane, the CB6 wheel can be utilized in forming complexes with other guests (i.e., spermine) present in the mixture.
dc.description.department Ústav chemie
dc.thesis.degree-discipline - cs
dc.thesis.degree-grantor Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně. Fakulta technologická cs
dc.thesis.degree-grantor Tomas Bata University in Zlín. Faculty of Technology en
dc.thesis.degree-name Ph.D.
dc.thesis.degree-program Technologie makromolekulárních látek cs
dc.thesis.degree-program Technology of Macromolecular Substances en
dc.identifier.stag 69624
dc.date.submitted 2024-12-11


Files in this item

Files Size Format View Description
zavodna_2025_teze.pdf 4.862Mb PDF View/Open
závodná_2025_dp.pdf 3.604Mb PDF View/Open None
závodná_2025_op.zip 578.3Kb application/zip View/Open None
závodná_2025_vp.pdf 597.6Kb PDF View/Open None

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Find fulltext

Search DSpace


Browse

My Account